氧气是维持生命的最基本物质，医疗上用来给缺氧病人补充氧气。氧气还用于高压仓治疗潜水病、煤气中毒以及用于药物雾化等。二氧化碳用于腹腔和结肠充气，以便进行腹腔镜检查和纤维结肠镜检查。此外,它还用于试验室培养细菌(厌氧菌)。固体二氧化碳用于冷冻疗法，用来治疗白内障、血管病等。氩气、氦气医疗上用于氩气刀、氦气刀等手术器械。

氮气医疗上用来驱动医疗设备和工具。人少量吸入一氧化二氮有麻醉止痛作用，大手术时常要与巴比妥类药物、琥珀酰胆碱、鸦片制剂、环丙烷、乙醚等联合使用，以增强效果。